Traditionnellement, une personne diagnostiquée avec le syndrome Swyer a été encouragé par les membres de la famille et des médecins à vivre la vie comme une femme parce que la partie externe du corps semble femelle. Cela a parfois causé des problèmes émotionnels pour ceux qui luttent avec des questions d'identité de genre. En raison de la présence de chromosomes masculins, certaines personnes atteintes de cette maladie sont l'identification plus confortable que des hommes. Thérapie psychologique approfondie et des conseils pour le patient ainsi que la famille peut être recommandée dans ces situations. Si le patient décide de vivre la vie comme un homme, différents types de traitement hormonal peuvent être utilisés, et une intervention chirurgicale est possible pour que le corps physique ressemble plus à celui d'un homme typique.