Une autre fonction importante de la trompe d'Eustache est de drainer le mucus de l'oreille interne. Les rhumes, les allergies et les infections des sinus, cependant, peuvent causer le tube à s'enflammer ou bouché avec un excès de mucus. L'obstruction résultant empêche la trompe d'Eustache de fonctionner correctement, ce qui conduit à la congestion de l'oreille et du liquide dans l'oreille. Un nez qui coule, la congestion de la tête, et le larmoiement sont d'autres symptômes à surveiller.