Colorants qui lient les acides nucléiques se lient l'ADN et l'ARN, et présentent des luminosités similaires, assurant ainsi un échantillon propre de l'ARN est importante. La manière habituelle d'accomplir cela consiste à ajouter une enzyme qui détruit l'ADN, telles que la DNase, d'un échantillon mélangé avant d'ajouter un colorant. Selon la concentration de l'ARN dans un échantillon, et qui contaminants sont présents, les laboratoires peuvent utiliser l'une de ces méthodes pour quantifier l'ARN.