Chimie analytique qualitative est plus commodément divisée en deux types: l'analyse organique et inorganique analyse. Chimie analytique qualitatif biologique est la plus complexe des deux. Il y a des millions de composés organiques possibles, dont des milliers sont connus et ont été caractérisés. Une structure moléculaire organique typique peut comprendre des chaînes ou des anneaux, des noyaux aromatiques, des liaisons éther, des hétéro-atomes, doubles et triples liaisons, plus l'alcool et de fonctionnalités carbonyle, carboxyle aliphatiques. Méthodes instrumentales d'identification sont essentielles et comprennent généralement la Chromatographie gaz-liquide et l'électrophorèse, ainsi que de l'infrarouge, l'ultraviolet et par spectroscopie de masse.