Depuis la phylogénie moléculaire est devenu largement disponible dans les années 1970, plus d'animaux ont été classés comme incertae sedis, parce taxonomistes sont moins disposés à deviner la place d'un taxon moins qu'il soit évident. Par exemple, dans la famille Colubridae de serpents, il y a plus d'une douzaine de genres énumérés comme incertae sedis. En taxonomie, il y a aussi une tendance croissante à mettre une base (primitive) taxons dans le clade qui contient ses ancêtres, mais s'abstenir de donner une classification plus précise. Par exemple, un reptile de base peut être considéré comme faisant partie de la classe Sauropsida avec d'autres reptiles, mais pas donné une famille ou la désignation de genres. Ces sortes d'animaux sont relativement rares, et la plupart sont des fossiles.