Il y a à la fois organique et inorganique, ou biologique et minérale, des exemples d'acides diprotique qui se produisent naturellement et en tant que substances d'origine humaine. L'acide sulfurique est un exemple d'un acide minéral, tandis que l'acide ou le goût de certains fruits, comme les pommes, les raisins et les cerises, est due à l'acide malique, qui est un acide diprotique organique. Cet acide se produit dans les fruits mûrs plus, mais se décompose comme le fruit mûrit, de sorte que le fruit devient moins tarte à mesure qu'il vieillit.