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FISH est utilisé pour déterminer si les chromosomes présentent des anomalies. Il peut s'agir de délétions chromosomiques, des réarrangements ou translocations, dans lequel deux chromosomes ont commutés segments. FISH permet également aux chercheurs de visualiser des gènes spécifiques. On peut déterminer si un certain gène est présent, où il se trouve sur les chromosomes, et si plusieurs copies sont présents. C'est ce qu'on appelle la cartographie des gènes.
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Les avantages et les inconvénients de l'hybridation fluorescente in situ sont mieux décrits par exemple. FISH est couramment utilisée dans le diagnostic du cancer du sein afin de déterminer si un patient a des copies multiples d'un gène appelé HER2. Cela indique généralement une forme plus agressive de cancer du sein, et que le patient doit recevoir certains médicaments dans le cadre de leur traitement. FISH peuvent être utilisés pour cela, car la séquence de paires de bases et la localisation chromosomique du gène HER2 sont connus. En revanche, les poissons ne peuvent pas être utilisées pour déterminer quel gène ou des gènes inconnus a causé le cancer du sein, ou pour le dépistage de cancer du sein en général.
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Hybridation fluorescente in situ présente des inconvénients. Etant donné que la clef de FISH est de connaître la séquence et / ou la localisation d'un gène de la paire de bases, il ne peut pas être utilisée en tant qu'outil de dépistage général. Il est aussi plus cher que les autres techniques, moins spécifiques et peuvent ne pas être disponibles dans tous les laboratoires ou les hôpitaux.
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Hybridation fluorescente in situ, également connu comme l'hybridation fluorescente in situ dans, est plus communément appelée FISH. C'est une technique qui consiste à utiliser un court brin d'ADN marqué avec un colorant fluorescent pour détecter des anomalies génétiques. FISH permet aux enquêteurs de visualiser les chromosomes, les parties de chromosomes ou des gènes spécifiques rapidement et avec précision. Ceci est souvent utilisé pour déterminer le pronostic et le traitement de certaines maladies, en particulier des cancers.
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Si les enquêteurs savent ce gène qu'ils recherchent, FISH est rapide et précis à trouver. FISH peuvent également être effectuées même si les cellules ne se divisent pas activement, et il fournit des informations plus spécifiques sur des anomalies dans les chromosomes. Des techniques plus classiques, tels que karotyping, disent les enquêteurs simplement le nombre et la taille des chromosomes dans une cellule.
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La technique d'hybridation fluorescente in situ tire parti de la nature complémentaire des brins d'ADN. Chercheurs d'abord créer une sonde. Il s'agit d'un court, simple brin de l'ADN qui est complémentaire à la séquence génétique du chercheur est à la recherche. La sonde est ensuite marqué ou fixé à un colorant fluorescent.
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En utilisant un microscope à fluorescence spécial, le chercheur se penche sur l'échantillon. Si le gène ou d'un chromosome spécifique est présente dans les cellules de l'échantillon, il apparaît comme une lumière fluorescente sur un fond sombre. Les chercheurs peuvent facilement voir si le gène est présent ou non, et si c'est le cas, le nombre de copies du gène sont dans chaque cellule. Si le chercheur est à la recherche de l'emplacement d'un gène, il ou elle peut voir où sur le chromosome il est. Un microscope optique ordinaire ne peut pas être utilisé avec des poissons, parce que le colorant fluorescent dégage un niveau de lumière très faible.
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La constitution génétique d'une personne se trouve dans leur ADN, qui est situé dans le noyau de toutes les cellules. ADN comporte deux brins qui sont complémentaires les unes aux autres. En d'autres termes, ils ont des molécules appelées paires de bases qui correspondent exactement ainsi. Les gènes sont des segments d'ADN ayant une séquence particulière de paires de bases et qui sont situés sur des zones spécifiques de chromosomes. Les gènes sont hérités et de déterminer comment les cellules fonctionnent, mais ils peuvent aussi devenir muté si la séquence de paires de bases modifications de l'ADN.
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Les cellules provenant de tissus malades, par exemple une biopsie de la tumeur, représentent habituellement l'échantillon à examiner par FISH. L'échantillon est chauffé pour dénaturer l'ADN dans les noyaux des cellules. Cela signifie que les doubles brins d'ADN dans les cellules échantillons se brisent pour former des brins simples. Une sonde spécifique de FISH est ensuite hybridée avec l'échantillon. En d'autres termes, seul brin de la sonde est introduite et fusionne avec son brin unique gratuit dans les cellules de l'échantillon dénaturées.
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Utilisation d'hybridation de l'ADN avec des sondes a été réalisée dans les années 1960;  Cependant, les sondes ont été marquées avec des substances radioactives plutôt que des fluorescents. Cela a eu plusieurs problèmes. Les substances radioactives sont intrinsèquement instable, dangereux et exigent des protocoles spéciaux pour l'élimination. Il prend aussi beaucoup de temps pour mesurer le signal radioactif émis par la sonde hybridée. La technique d'hybridation fluorescente in situ permet de surmonter la plupart de ces obstacles.
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