La division des couches germinales est particulièrement évident lors de l'embryogenèse, lorsque l'embryon se développe à partir d'un seul œuf fécondé dans un organisme prêt à vivre sur son propre. D'une manière générale, l'ectoderme différencie dans le système nerveux, de l'épiderme, et la partie extérieure du système de tégument (cheveux, des échelles, des ongles, des glandes sudoripares, etc.) Le mésoderme différencie dans la paroi de l'intestin, qui organise les coussins et les organes internes. L'endoderme différencie dans les cellules de la paroi de la plupart des organes internes, y compris l'ensemble du système digestif. Ensemble, ces couches germinales représentent l'organisme.