Depuis les maladies respiratoires, les infections bactériennes et les infections virales se produisent le plus souvent dans les mois les plus froids, la pharyngite est plus fréquente au cours de la même saison. En outre, l'inflammation peut être causée par de l'air sec, ce qui est courant dans les mois d'hiver en raison du chauffage à l'intérieur. Il existe également des causes qui ne concernent pas les micro-organismes, y compris les lésions chimiques, le tabagisme, la maladie de reflux gastro-oesophagien, l'intubation endotrachéale, et néoplasie. Allergies et rhinopharyngite peuvent également conduire à une pharyngite.