Le corps sécrète généralement zymogènes plutôt que des enzymes actives, car ils peuvent être entreposés et transportés en toute sécurité sans nuire aux tissus environnants, et libérés lorsque les conditions sont favorables pour une activité optimale. Par exemple, le pepsinogène est sécrétée dans l'estomac et clivé pour former la pepsine, une enzyme qui décompose les protéines ingérées comme nourriture. Les conditions fortement acides de l'estomac induisent effectivement clivage du pepsinogène et favorise l'activité de la pepsine. Une fois la digestion se déplace vers l'intestin grêle, cependant, le changement radical dans l'inactivation de la pepsine pH et deux autres zymogènes sont libérés.