Les chromosomes d'une même paire sont de même longueur, et ont les mêmes allèles de codes pour différents traits situés dans les mêmes positions le long de leurs longueurs. Cependant, les alleles peuvent être différents. Une personne peut avoir un allèle pour les cheveux blonds et un pour les cheveux brun, par exemple. Selon ce qui est dominante, un seul trait sera exprimé. Certaines personnes héritent de deux allèles identiques, un de chaque parent, dans ce cas, la paire homologue aura des copies identiques.