Les biomarqueurs peuvent prendre une grande variété de formes. Par exemple, certains biomarqueurs peuvent être utilisés pour indiquer la présence de certains micro-organismes, y compris des antécédents de leur présence, même si elles n'existent plus. Un exemple classique d'un tel biomarqueur est un anticorps, une substance développée par le corps pour l'aider à combattre la maladie. Les biomarqueurs peuvent également être utilisés pour différencier les cellules; certains traitements du cancer, par exemple, sont conçus pour cibler des cellules spécifiques, en utilisant leurs biomarqueurs comme une étiquette.