Documents des bases de données XML magasin de données XML natives dans son ensemble, au lieu de séparer les données en leur sein, et sont conçus pour stocker des informations semi-structurées, telles que des brochures de marketing ou des données de santé. documents XML qui contiennent des données semi-structurées sont appelés centrée sur les documents. Une base de données XML native n'est pas conforme à un certain modèle de stockage physique, être capable d'utiliser des structures relationnelles, hiérarchiques, ou orientée objet ainsi que les formats de stockage personnalisé. Il gère les documents en les regroupant en ensembles logiques, et peut mettre en place et gérer plusieurs collections simultanément. Ce type de base de données permet à l'utilisateur de stocker n'importe quel type de document XML, indépendamment de la structure, dans la même collection. Les requêtes peuvent être construites à travers toute la collection, rendant généralement l'organisation des données et la manipulation plus souple.